饮水安全问题举世关注。目前，全世界约有12亿人缺少安全饮用水，每年水源性疾病人数10亿人以上。联合国环境和发展机构指出，人类约有80%的疾病与微生物感染有关，其中60%以上是通过饮用水传播的。世界卫生组织《饮用水水质准则》指出：在与饮用水有关的安全问题中，微生物问题列于首位。在发展中国家，80%的人群疾病和50%的儿童死亡率与饮用水水质有关，平均每年约有2.5亿人因饮用不洁净的水而发生疾病。
天然水体中能感染人类的病原微生物主要包括细菌、病毒和原生动物等，多数病原微生物来源于人及动物的粪便。农村供水水源多是地表水和浅层地下水，极易受病原微生物污染。病原微生物在水体中一般能存活数日甚至数月，有的还能繁殖生长。受病原微生物污染的水体，如不经消毒处理极易导致介水传染病的发生和流行。
在我国农村，由于水体污染加剧和水源保护不到位，饮用水源污染问题突出，其中微生物污染是饮用水源污染的主要类型。在农村饮水解困阶段，卫生部门1983—1985年对农村饮用水源的卫生状况调查表明，大肠菌群超标率达86%，全国有7亿人饮用这种超标水；1993年在全国26个省的180个县开展的饮用水卫生监测网检测结果显示，微生物指标超标严重：饮用总大肠菌群每升水超过3个的人口占调查总人口的51.8%，饮用水细菌总数每升水超过10万个（100个/mL）的人口占调查总人口的39.1%，在一定程度上反映了我国农村饮用水微生物污染状况。由于农村饮用水微生物指标超标严重，不可避免地造成了当时肠道传染病的流行，我国几次大的介水传染病的爆发充分反映问题的严重性。
介水传染病（water－borne communicable diseases）是通过饮用或接触病原体污染的水而传播的疾病，又称水性传染病。其主要原因是水源受病原体污染后，未经处理和消毒即供居民饮用，或处理后的水在输配和储存过程中重新被病原体污染。据报道，大约有40多种传染病可通过水而传播，如霍乱、痢疾、伤寒、副伤寒等肠道传染病，肝炎、脊髓灰质炎、眼结膜炎等病毒性疾病和血吸虫病、钩端螺旋体病、阿米巴痢疾等寄生虫病。
介水传染病一般以肠道传染病多见，最典型的例子是1955年11月至1956年1月期间，印度新德里由于集中式给水水源受生活污水污染而暴发的传染性肝炎流行，在170万人口中出现的黄疸病例2.93万人。2000年，加拿大的Walkerton小镇，由于饮用水受污染和消毒系统失效，导致全镇5300多人中2300多人住院，7人死亡，引起发达国家重视。2004年，阿根廷罗哈斯市的2.3万居民中有近3000人感染了志贺细菌性痢疾，原因是水厂中3/4的投药设备发生故障，没有加氯消毒，同时管网系统缺乏维修保养，蓄水设施没有清洗，造成痢疾杆菌通过自来水管道传播蔓延。隐孢子虫感染人体导致腹泻是世界上腹泻病常见的原因。患有隐孢子虫病的人或动物的粪便如果污染了饮用水或饮用水源，可导致介水疾病流行。1987年，美国佐治亚州（Geor-gia）某地发生隐孢子虫病流行，在6.49万当地居民中有1.30万多人染病，出现腹泻，从病人粪便及出厂水中检出隐孢子虫囊。1993年，美国威斯康星州（Wiscon-sin）密尔沃基（Milwaukee）也发生过一次涉及40.3万人的经自来水传播的隐孢子虫病大爆发，5万多人住院，112人死亡，引起了全世界关注。2009年，我国内蒙古自治区赤峰市因自来水受病原微生物污染导致4322人住院。
为防止介水传染病的发生和流行，生活饮用水必须消毒。世界卫生组织在《饮用水水质准则》中将微生物问题和消毒的重要性排列在前二位；美国EPA在《国家饮用水水质标准》中明确规定：饮用水必须经过消毒。我国《生活饮用水卫生标准》（GB 5749—2006）对饮用水消毒做出了强制性规定。在4.1.1条中规定“生活饮用水中不得含有病原微生物”，在4.1.5条中规定“生活饮用水应经消毒处理”。在“表1水质常规指标及限值”中规定，日供水在1000m3以上（或供水人口在1万人以上）的集中式供水中，菌落总数指标限值是100CFU/mL，总大肠菌群、耐热大肠菌群或大肠埃希氏菌不得检出，贾第鞭毛虫和隐孢子虫指标限值是1个/10L。在GB 5749—2006“表4农村小型集中式供水和分散式供水部分水质指标及限值”中规定，日供水在1000m3以下（或供水人口在1万人以下）的农村小型集中或分散式供水中，菌落总数指标放宽到500CFU/mL，其余3项微生物指标仍为不得检出。
2005年以来，国务院先后批准实施了《2005—2006年农村饮水安全应急工程规划》《全国农村饮水安全工程“十一五”规划》和《全国农村饮水安全工程“十二五”规划》，全国开展了大规模的农村饮水安全工程建设。到2015年年底，全国新建农村集中供水工程50万处，解决5.2亿农村居民饮水安全问题。全国农村集中供水口比例由2004年的38%提高到80%以上，极大地改善了农村饮水卫生状况。
近年来，由于水环境污染加剧和饮用水水质标准提高，保障供水水质安全的任务十分艰巨。由于农村供水工程量大面广，水处理、消毒与水质检测环节薄弱，以及工程运行管理水平低等原因，水质合格率还比较低，其中微生物指标不合格是主要原因之一。根据有关部门监测结果，如能正确选择和使用适宜农村供水的消毒技术及设备，实现消毒效果达标，供水水质合格率可提高20%～30%，更加凸显饮用水安全消毒对提升农村供水水质、保障饮水安全的重要意义。
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